Xuất xứ của tổ yến Khánh Hòa đến từ vùng biển Khánh Hòa, vùng đất có khí hậu lý tưởng cho chim làm tổ. Đặc trưng nổi bật của tổ yến này chính là màu sắc đỏ tươi , vì chứa số lượng sắt, làm cho giá trị sử dụng cao so với các loại yến khác . Ngoài ra , tổ yến Khánh Hòa thường gặp hình dạng không đề